3.4 Identifikation

Grundsätzlich werden alle aus klinischen Proben gewachsenen Pilze identifiziert. In einem ersten Schritt werden morphologisch makro- und mikroskopische Eigenschaften beurteilt. Hefen werden zusätzlich mit MALDI-TOF MS identifiziert, falls eine morphologische Identifikation nicht schnell möglich ist. Dermatophyten und Schimmelpilze werden meist anhand der morphologischen Eigenschaften identifiziert. Wo notwendig und nach Rücksprache mit dem Auftraggeber wird zur Identifikation die Sequenzierung der Internal Transcribed Spacer (ITS) Region eingesetzt ( siehe Kapitel 5).
Pilze aus externen Kulturen, die sich nicht mit konventionellen morphologischen Kriterien identifizieren lassen, werden molekularbiologisch identifiziert.
Wenn ein Pilzisolat beim Sequenzvergleich mit Datenbanken nicht molekulargenetisch identifiziert werden kann, handelt es sich in der Regel um ein Umweltisolat ohne klinische Relevanz.

Referenzen:

Name changes in medically important fungi and their implications for clinical practice.
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